自然衰老与诱导模型：差异基因、功能及同向／反向比较

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自然年龄仅GSE281449与GSE130973；PPT和PDF均为12页。完整CSV包含阴性、不可测及功能注释结果。

功能注释后台加载中；可先查看统计、模型比较与下载文件。

差异基因列表

先选模型类别和具体比较，再按方向、功能或基因名筛选。默认显示全部FDR≤0.05基因，不按数量截断；分页只影响页面显示。单样本比较自动改为“仅描述”。

正在加载当前基因表；下载较慢时可先查看下方统计及模型比较…

基因名下显示官方名称与类型；展开功能栏可查看UniProt原文和来源。功能标签描述已知生物过程，表达升降不等于功能增强／下降。未匹配注释与未检测到表达是不同状态。

当前比较：上调／下调基因的功能富集

自然衰老：两个RNA队列综合，保留来源差异

仅纳入GSE281449与GSE130973，共11位供体，8,519个共同可检验基因。综合FDR≤0.05为0个，方向性复现检验也无FDR达标基因。当前没有正式的综合差异基因签名。

保留68个探索性同向候选：两队列分别P≤0.10且|log₂FC|≥0.25，并且方向一致。其用途为模型比较线索，不等于统计复现。Basal和Spinous的综合FDR显著基因仍为0；Granular和Cycling缺少合格跨来源比较，保留单来源信息。

诱导与处理模型：按数据集分别查看

点击比较名称，直接切换上方的完整基因列表。相同数据集不同时间点、剂量及遗传背景分开；共用对照不会被当成独立研究。药物／抗氧化处理与其对照的比较另列，不与衰老诱导混合。

复制样衰老E-MTAB-10969有35个FDR基因，目前没有达到门槛的GO富集。SenCat依托泊苷模型的下调基因富集于DNA复制、修复和RNA剪接；其上调基因涉及免疫、黏附与表皮发育。HaCaT短时H₂O₂的上调基因富集于未折叠蛋白应答等过程，不能将这些急性应答直接等同于稳定衰老。完整的时间、剂量及条件性限制保留在每个比较详情中。

方法、功能注释与完整交付

本轮重新核算自然年龄的带方向综合统计、差异基因名单和功能富集。诱导模型的输入、设计和比较未改变，复用已核验的edgeR／limma模型输出，重新构建逐数据集、逐比较的基因表和上下调统计。未重新处理FASTQ，没有为凑基因数量改变阈值。

自然年龄采用等权带方向Stouffer综合P；All_KC单独BH校正，四个细分层级合为一个校正家族。另给方向性部分合取复现检验。模型基因表保留逐比较完整检验家族的BH FDR；FDR≤0.05为默认差异门槛，可另看|效应|≥0.5。作者归一化表达的效应保持其原单位，不换称原始计数log₂FC。

功能信息来自2026-10-26获取的NCBI人基因名称、UniProt人工审校人类蛋白功能和GO注释，并保留既有KC面板。中文功能分类按公开注释归类；重点基因增加中文释义，其他基因可展开阅读功能原文。同义名若与不同的正式基因ID冲突，不进行功能映射。无明确功能注释的基因仍保留。

GO富集为探索性超几何检验：每个比较使用自身可检验且有精确符号GO注释的基因作背景，上调／下调分开；自然年龄用综合FDR基因，诱导模型用FDR≤0.05且|效应|≥0.5的基因。背景内每个GO集合10–500个基因，对该比较全部合格条目和两个方向一起BH校正，展示FDR≤0.05且重叠≥3的条目。未传播GO祖先条目，未调整RNA长度偏倚；GO证据来自多个组织，不证明KC中特定功能已改变。

• 所有比较的上下调基因数与名单索引
• 完整基因功能注释库（含原文、GO与来源）
• 逐比较的功能注释覆盖情况
• 全部GO富集结果（含不显著条目）
• 91条保留RNA样本记录的取材、培养与分组（非供体数）
• 中文分析说明 · 分析规则 · 核验记录

已有自然年龄来源及无法新增推断分析的模型仍可在历史v8归档（含本页已排除的分支）查看；GSE245757的作者筛选miRNA表不混入本轮mRNA差异名单。功能数据归属与使用说明见UniProt许可。